Файловая система FAT32 ( FAT16 ) в настоящее время используется во флешках и картах памяти. Гораздо реже во внешних жестких дисках (что, кстати, создает проблемы при работе с файлами большого объема). FAT является менее устойчивой по сравнению с файловой системой NTFS. Вся информация о размещении файлов и директорий , так называемая таблица FAT расположена в самом начале жесткого диска или флеш носителя.
И при возникновении программного сбоя или появления bad блоков (физического повреждения ) в системной области жесткого диска FAT, ссылки на файлы и директории нарушаются.
Таблицы FAT могут пострадать и при случайной записи на жесткий диск поверх имеющихся данных. Так как таблицы FAT расположены в начале жесткого диска, то и вероятность их повреждения выше.
При сильном или полном разрушении или перезаписи файловых таблиц, восстаносление данных возможно только в RAW формате. Восстанавление файлов происходит только по их заголовкам, без привязки их к директориям и другим файлам. 
На данным момент большинство флеш носителей использует как раз систему FAT.
Поэтому при работе с флешками надо быть максимально внимательными не предпринимать необдуманных действий при сбое флешки или проблемах с файловой структурой накопителя.
